Z OS Windows není možné přímo přistupovat k systému souborů typu ext2 a ext3, které Linux může používat. K tomuto účelu je třeba stáhnout aplikaci Explore2fs popř. fs-driver.org.
Na oddíly s nejnovější verzí souborového systému ext4, zatím není možné přistupovat nijak.
Linux však může využívat i jiné souborové systémy (jako ReiserFS, UFS, XFS apod), na které z OS Windows také přistupovat nelze.